區行政審批局設下列內設機構：
（一）辦公室。負責機關日常運轉，承擔文電、信息、宣傳、機要、檔案、建議提案辦理、文明創建、扶貧幫困、行政后勤等工作；負責重要會議和活動的組織安排并督辦落實；負責重要文件、綜合性文稿起草和重大課題綜合調研工作；負責機關財務管理、資產管理和內部審計工作；負責機關及所屬事業單位的干部人事、機構編制、勞動工資、教育培訓等工作；負責機關及所屬事業單位人才隊伍建設，指導所屬事業單位的專業技術職務評聘工作；負責干部檔案管理工作；組織局機關和所屬單位工作人員的年度考核、獎懲工作；負責機關及所屬事業單位出國（境）人員審核報批工作；負責離退休干部工作。
（二）政策法規科。負責規范性文件的制定并對實施情況進行監督檢查；牽頭依法行政和法治建設工作；組織開展行政審批執法監督工作，負責有關行政許可決定的審核，牽頭組織行政許可決定撤銷工作；承擔聽證、行政復議、行政應訴等工作；負責行政審批法律法規的宣傳、執法人員培訓和管理工作；承擔行政權力清單的編制和調整工作；負責政務公開工作。
（三）行政審批制度改革科。負責研究提出全區“放管服”改革工作的政策措施，提出取消下放行政許可事項的意見；負責清理規范涉審中介服務、優化行政審批流程、推進“不見面審批（服務）”改革和“3550”改革工作，參與“證照分離”改革；承擔區政府推進職能轉變和“放管服”改革協調小組辦公室、區行政審批制度改革工作領導小組辦公室的日常工作。
（四）基層政務服務科。參與推進全區為民服務網絡建設，加強對區鎮（街道）為民服務中心、村（社區）便民服務中心的業務指導；負責對各區鎮（街道）為民服務中心、村（社區）便民服務中心的目標考核；做好對各區鎮（街道）為民服務中心、村（社區）便民服務中心的效能監察指導；完善全區區鎮（街道）、村（社區）兩級便民服務平臺軟硬件建設；協調、推進各類行政審批、便民服務事項的下放；指導區鎮（街道）、村（社區）政務服務標準化建設。
（五）業務指導科（信息科）。承擔審批局行政審批制度改革組織協調工作；研究、提出審批局貫徹深化行政審批制度改革的措施及建議；負責行政審批“三集中、三到位”工作的推進；推進政務服務信息化建設，負責“互聯網+政務服務”“互聯網+監管”建設、指導、協調、監督；指導協調審批業務的流程再造、聯合辦理、跟蹤服務；負責牽頭推進行政審批中介服務改革，對中介服務項目目錄清單等信息進行更新，并依托江蘇省政務服務網進行發布，對中介機構進行星級評定、公示、發布和結果運用；負責對政務服務代辦幫辦工作的指導、管理和協調。
（六）市場準入科。負責全區內資有限公司及分公司、內資非公司企業法人、內資非法人企業、非公司私營企業及內資非公司企業分支機構、個體工商戶、農民專業合作社及其分支機構登記注冊工作；負責對外貿易經營者備案登記；負責單用途商業預付卡發卡企業的備案；負責與業務關聯部門的銜接、溝通、協調等工作。（賦權開發區的除外）
（七）投資管理科。負責權限內的政府投資項目審批與企業投資項目核準、備案；負責權限內建設項目環境影響評價文件審批、固定資產投資項目節能評估和審查；協助業務相關中介服務機構的管理工作；負責工程建設項目招標事項核準；負責牽頭組織江蘇省投資項目在線審批監管平臺相關工作。
（八）規劃審查科。負責全區建設項目規劃許可審批工作；負責建設工程規劃許可證、鄉村建設規劃許可證的審批和發放；負責建設項目規劃審批業務的信息交流、技術培訓等工作；負責全區建設工程設計方案審核和技術指導；參與全區范圍內修建性詳細規劃的論證工作；負責新建民用建筑不建人民防空地下室審批；協助業務相關中介服務機構的管理工作。
（九）安全審查科。負責危險化學品經營許可；負責煙花爆竹零售經營許可；負責第三類非藥品類易制毒化學品經營備案；負責危險化學品經營單位應急預案備案；負責公共場所及集中式供水單位衛生許可；負責放射診療許可；負責藥品經營，第三類醫療器械經營許可；負責第二類醫療器械經營備案；負責出版物發行（零售）單位，歌舞娛樂場所，電子游戲游藝娛樂場所，互聯網上網服務經營場所，營業性演出，電影放映經營，一次性內部資料出版物許可；負責衛星地面接收設施安裝，出版物出租單位，演出場所，藝術品經營單位，文物保護單位核定等審批及備案；負責組織業務相關的現場踏勘、竣工驗收等工作；負責與業務關聯部門的銜接、溝通、協調等工作。
（十）工程許可科。負責建設工程安全監督備案；負責建設工程質量監督備案；負責建筑工程施工許可核發；負責防雷裝置竣工驗收；牽頭組織業務相關的建設工程聯合踏勘、聯合竣工驗收等工作，負責權限內竣工驗收備案；協助業務相關中介服務機構的管理工作；負責金屬冶煉建設項目安全設施設計審查。
（十一）標準化建設管理科。負責政務服務綜合標準化建設工作的推進實施；負責編制、實施政務服務綜合標準化建設工作的總體目標、中長期規劃和行動計劃；負責編制、貫徹和完善政務服務綜合標準體系，并對政務服務標準體系的運行情況進行督查考核；負責開展相關標準的基礎性研究；負責行政審批、政務服務相關規范標準的宣傳和培訓工作。
（十二）督查科。負責區政務服務大廳日常管理工作，負責對各進駐部門、單位的政務服務行為進行監督檢查，對窗口工作人員進行日常管理、教育培訓和監督考核；承擔政務服務大廳服務投訴受理、調查和處置工作；承擔審批服務群眾滿意度測評、群眾意見建議反饋和測評結果運用工作；會同有關科室推進政務服務綜合標準化建設和宣貫工作；負責效能建設、信訪維穩、突發事件處置等安全和應急管理工作；負責政務服務業務數據統計分析工作；負責服務大廳的參觀、檢查的接待工作。
機關黨委。負責機關及所屬事業單位的黨群工作。